2012年，蛇口集装箱码头累计完成集装箱吞吐量451.6万标箱，同比增长11%，其增幅远高于深圳港的平均增幅。截至2012年12月，挂靠蛇口集装箱码头的国际集装箱航线达到81条，较2011年同期新增2条。
据蛇口集装箱码头介绍，去年在面对外贸进出口业务量萎缩情况下，码头及时调整商务策略，强化航线箱量管理和航线特色服务，在稳定航线的基础上加强货源开发和客户服务工作，使码头全年吞吐量保持持续稳定的增长。
统计数据显示，去年5月份蛇口集装箱码头单月首破40万标箱，创下吞吐量的新高。其后的6、7、8月更是高歌猛进,期间单船操作量、日吞吐量等也一项一项先后刷新历史记录,8月份该码头吞吐量达到历史峰值44.36万标箱。